El primer sistema operativo de la compañía que lanzó al público fue una variante de Unix en el año 80. Adquirido de AT&T a través de una licencia de distribución, Microsoft le apodó Xenix, y alquiló la empresa Santa Cruz Operation para adaptar su sistema operativo a importantes plataformas. Microsoft se comprometió a actualizar sus aplicaciones basadas en Windows, incluyendo Microsoft Excel, Word y PowerPoint. En 1991 la empresa alcanzó un hito importante, con más de la mitad de todos los ingresos procedentes de las aplicaciones en lugar de productos de sistemas .
La compañía fue fundada en 1975 por William H. Gates III y Paul Allen. Ambos se habían conocido durante su época de estudiantes por su afición común a programar con la computadora PDP-10 de Digital Equipment Corporation.